O Programa de Pós-graduação em Epidemiologia (PPGEpi) tem se caracterizado por proporcionar sólido embasamento em epidemiologia, acrescido da perspectiva de capacitação para coordenação dos serviços de saúde, no que diz respeito à tomada de decisões em saúde pública, com base na melhor evidência científica disponível.

A estrutura curricular do Programa está baseada em dois pilares importantes: teoria e prática epidemiológica. A estrutura docente é multidisciplinar, com professores lotados nos Departamentos de Medicina Social da Faculdade de Medicina, da Faculdade de Nutrição, do Departamento de Desportos da Escola Superior de Educação Física e do Departamento de Odontologia Restauradora da Faculdade de Odontologia. Os docentes permanentes são altamente qualificados, tendo a quase totalidade deles bolsistas de produtividade do CNPq e com considerável participação em instituições científicas e/ou acadêmicas no Brasil e em outros países.

O Programa possui quatro áreas de concentração: Epidemiologia do Ciclo Vital; Epidemiologia dos Serviços de Saúde; Determinantes Sociais do Processo Saúde-Doença-Cuidado e Equidade em Saúde. Cada área possui suas linhas de pesquisa. 

O PPGEpi ainda dispõe de estágio Pós-doutoral, ou seja, um aperfeiçoamento factível para profissionais que tenham obtido grau de Doutor, ou equivalente no exterior, devidamente revalidado no Brasil, com permanência mínima de dois meses na sede do Programa.